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Arlequin(遗传学分析软件) V3.5.2.2绿色版

[下载地址]
  • 软件大小:24.3MB
  • 更新日期:2020-11-25
  • 软件语言:其他语言
  • 软件授权:国产软件
  • 软件热度:
  • 官方网站:暂无
  • 适用平台:WinAll/

  Arlequin(遗传学分析软件)是一款技术专业的人们遗传学数据统计分析软件,这款软件关键为从业医药学、分子生物学科学研究的客户设计方案,对遗传学有兴趣爱好的客户能够根据软件对数据统计中信息的发掘,可开展AMOVA测算、中性检验、失衡遍布等

Arlequin(遗传学分析软件)

【基础介绍】

  Arlequin是一款技术专业的人们遗传学数据统计分析软件,这款软件关键为从业医药学、分子生物学科学研究的客户设计方案,能够从遗传学和人口数量统计学数据信息中发掘信息,比如:很多的分子结构编码序列数据信息和传统式的等基因频率,并出示了许多 的方式和统计学检验,可以满足客户需求多种多样遗传学剖析便捷的要求!集成化了单倍型頻率估计、Tajima中性检验、Fu中性检验及其基因遗传间距的估计等作用。那样就可以精确合理的对人们遗传学数据信息开展发掘。仍在等哪些,对遗传学有兴趣爱好的客户能够根据软件对数据统计中信息的发掘,可开展AMOVA测算、中性检验、失衡遍布等。

【软件特点】

  1.Molecular diversity(分子结构多态性);

  2.Mismatch distribution(失衡遍布);

  3.Haplotype frequency estimation(单倍型頻率估计);

  4.Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检验不一样结构域上等位基因的非任意关系);

  5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格均衡);

  6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验);

  7.Fu`s neutrality test(Fu中性检验);

  8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验);

  9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 结合检验,检验群体的均一性或无偏性和中性挑选等);

  10.Minimu Spanning Network(最少扩大树或称作最少支撑点树,,根据分子结构差别);

  11.AMOVA 分子结构差别度剖析,用于测评群体的基因遗传构造;

  12.Pairwise genetic distances (基因遗传间距的估计);

  13.Exact test of population differentiation (检验随机交配人群单倍型的非随机分布);

  14.Assignment test of genotype (根据估计等位基因頻率将单独基因型分派到特殊的群体中);

【版本更新】

  1.立即从DNA序列数据信息测算结构域频带,但仅根据主次等位基因频带的SFS测算。

  2.打不开批处理命令(.arb)文档。

  3.当(假定先祖等位基因0)在一个网站不会有时,SFS测算欠佳。

  4.由arlequin和fastsimcoal2生产制造的不一样SFS(关键用以根据MAF的SFS)。

  5.假如文件夹名称超出255字符,则会失败。

  6.在arlequin日志文件中沒有提及SFS测算。

使用教程
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