Arlequin(遗传学分析软件) V3.5.2.2绿色版
- 软件大小:24.3MB
- 更新日期:2020-11-25
- 软件语言:其他语言
- 软件授权:国产软件
- 软件热度:条
- 官方网站:暂无
- 适用平台:WinAll/
Arlequin(遗传学分析软件)是一款技术专业的人们遗传学数据统计分析软件,这款软件关键为从业医药学、分子生物学科学研究的客户设计方案,对遗传学有兴趣爱好的客户能够根据软件对数据统计中信息的发掘,可开展AMOVA测算、中性检验、失衡遍布等
【基础介绍】
Arlequin是一款技术专业的人们遗传学数据统计分析软件,这款软件关键为从业医药学、分子生物学科学研究的客户设计方案,能够从遗传学和人口数量统计学数据信息中发掘信息,比如:很多的分子结构编码序列数据信息和传统式的等基因频率,并出示了许多 的方式和统计学检验,可以满足客户需求多种多样遗传学剖析便捷的要求!集成化了单倍型頻率估计、Tajima中性检验、Fu中性检验及其基因遗传间距的估计等作用。那样就可以精确合理的对人们遗传学数据信息开展发掘。仍在等哪些,对遗传学有兴趣爱好的客户能够根据软件对数据统计中信息的发掘,可开展AMOVA测算、中性检验、失衡遍布等。
【软件特点】
1.Molecular diversity(分子结构多态性);
2.Mismatch distribution(失衡遍布);
3.Haplotype frequency estimation(单倍型頻率估计);
4.Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检验不一样结构域上等位基因的非任意关系);
5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格均衡);
6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验);
7.Fu`s neutrality test(Fu中性检验);
8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验);
9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 结合检验,检验群体的均一性或无偏性和中性挑选等);
10.Minimu Spanning Network(最少扩大树或称作最少支撑点树,,根据分子结构差别);
11.AMOVA 分子结构差别度剖析,用于测评群体的基因遗传构造;
12.Pairwise genetic distances (基因遗传间距的估计);
13.Exact test of population differentiation (检验随机交配人群单倍型的非随机分布);
14.Assignment test of genotype (根据估计等位基因頻率将单独基因型分派到特殊的群体中);
【版本更新】
1.立即从DNA序列数据信息测算结构域频带,但仅根据主次等位基因频带的SFS测算。
2.打不开批处理命令(.arb)文档。
3.当(假定先祖等位基因0)在一个网站不会有时,SFS测算欠佳。
4.由arlequin和fastsimcoal2生产制造的不一样SFS(关键用以根据MAF的SFS)。
5.假如文件夹名称超出255字符,则会失败。
6.在arlequin日志文件中沒有提及SFS测算。